LipiORDER (Membrane Lipid Order Imaging Dye) 可定量观察活细胞的膜相态!

LipiORDER (Membrane Lipid Order Imaging Dye)
可定量观察活细胞的膜相态!

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可定量观察活细胞的膜相态!LipiORDER (Membrane Lipid Order Imaging Dye)                              可定量观察活细胞的膜相态!

LipiORDER <Membrane Lipid Order Imaging Dye>

LipiORDER (Membrane Lipid Order Imaging Dye)                              可定量观察活细胞的膜相态!

LipiORDER是环境响应型的荧光色素,可通过成像生物膜的相态 (Lipid order)Lo/Ld实现定量观察。即使在活细胞中也显示高度化学稳定性,且可观察到各种膜结构的相态,如细胞膜、细胞内膜等。

 本产品由funakoshi 株式会社基于高知大学教育研究部综合科复合领域科学部门 仁子阳辅博士的研究成果商品化并销售。

※ 本产品仅供研究,研究以外不可使用。

LipiORDER (Membrane Lipid Order Imaging Dye)                              可定量观察活细胞的膜相态!

LipiORDER成像和神经细胞染色示例

依赖生物膜相态的本试剂的荧光特性变化(左)和神经细胞神经突起部位的染色案例(右)

◆生物膜相态(Lipid order)是什么?


构成生物膜的脂质种类繁多,膜的状态因其脂质组成而大不同。例如,仅由饱和脂肪酸构成的脂质膜因密度高且包裹坚固的特点,被称为有序相(Lo);由含有不饱和脂肪酸脂质构成的脂质膜因密度低,被称为无序相(Ld)。像这样的脂质微环境被称为相态(Lipid order)。在简单模型中,Lo和Ld分离并发生明确的相分离(如图),但由于细胞生物膜中的脂质种类繁多,不会发生图中模型所示的简单相分离,而是反映总和性质的相态。

另外,膜蛋白的存在也被认为会影响相态,而实际细胞膜上的相态更为复杂。细胞膜上的Lo有时也被称为脂筏(Lipid raft),作为生物膜的功能域备受关注。这种脂质膜相态的观察对于理解膜的生物物理学性质(如生物膜的流动性和硬度等)非常重要,期待未来能开发出针对它的分析方法。

LipiORDER (Membrane Lipid Order Imaging Dye)                              可定量观察活细胞的膜相态!

脂质膜的相态成像

近年,Laurdan、di-4-ANEPPDHQ、Nile Red等响应分子极性并发生色调变化的荧光色素(solvatochomic dye) 已被应用于生物膜的相态可视化。由于这些分子极性响应型荧光色素会根据相态改变荧光波长,通过检测特定激发光中的两种波长的荧光获得其荧光强度比,可半定量分析相态。(详细信息,请参阅下述的“原理”)。

然而,这些试剂在实际使用中还存在如细胞内局部不均匀、对光不稳定等问题,。本产品LipiORDER利用高知大学的仁子阳辅博士和Strasbourg大学的Andrey Kylmchenko博士的团队开发的新型芘衍生物荧光探针(原著论文名PK),以及在Lo、Ld上荧光特性不同的特征,可定量分析生物膜相态。与Laurdan相比,显示极高的光稳定性,在活细胞中也能维持化学稳定性,因此活细胞成像优异。

 


参考:膜的相态成像应用实例


相态被认为是决定脂质膜流动性的参数,以Laurdan为首,相态成像被用于各种生命现象的分析。Laurdan会根据相态将荧光波长由蓝色(Lo)变为绿色(Ld),观察蓝色和绿色两种波长的荧光,其荧光强度比(绿色荧光强度/蓝色荧光强度)和GP值(generalized polarization;(Fblue-Fgreen/Fblue Fgreen)的计算值可用于评价相态。例如进行外部刺激(药物处理、氧化应激等)、基因操作(目的基因的过表达或敲降)引起的细胞形态结构变化及其相态的分析。此外,作为细胞功能分析的一环,还观察到了细胞类型间的相态比较。

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Laurdan:在观察到两种波长的荧光后,从观察图像中计算出荧光比(或GP值),使用拟色进行比率型图像分析。

◆原理


LipiORDER是根据溶剂的分子极性改变荧光特性的溶剂极性响应型荧光色素(Solvatochromic fluorescent dye)(图1)。此外,本试剂对脂质膜具有高亲和性,浓缩在细胞的膜结构中。通过这两个特点,本试剂根据膜内部的极性将荧光由绿色变为红色。相态反映了脂质的包裹密度,稀疏包裹的Ld极性高,而紧密包裹的Lo极性低,通过观察膜结构的极性可定量观察相态(图2上)。实际上,与模型Lo相(sphingomyelin/Cholesterol; SM/Chol)显示绿色荧光(荧光波长最大~510 nm)相对,模型Ld相(dioleylphosphatidylcholine;DOPC)发生长波长偏移,显示红色荧光(荧光波长最大~575 nm)(图2下)。另外,在被认为是SM/Chol与DOPC中间模型的DOPC/Chol中,观察到SM/Chol与DOPC中间的荧光光谱,可通过观察本试剂获得的绿色荧光强度FG(荧光显微镜中的检测波长范围约为500~550 nm)和红色荧光强度FR(检测波长范围约550~650 nm)的荧光强度比FR/FG,相对定量膜相态。

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图1. 溶剂的分子极性依赖性荧光响应性

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图2. 溶剂的分子极性依赖性荧光响应性

上图:根据相态的荧光特征变化图  下图:模型脂质体中的荧光光谱

◆特点


● 由405 nm激发产生的绿色荧光强度FG(500~550nm)和红色荧光强度FR(550~650nm)的荧光强度比FR/FG和相态之间存在相关性。

● ※ 本试剂几乎不被488 nm激光吸收,可作为激发488 nm以上的光的荧光色素使用。

● 显示出的性质:荧光比FR/FG的值越大,则越接近无序相Ld状态;FR/FG值越小,则越接近有序相Lo状态。

● 极性响应型荧光色素,在低极性环境中发出荧光。在水溶液中不发出荧光,在高S/N比下可观察到膜结构和脂肪滴。

● 只需将本试剂添加至活细胞中,即可摄入至细胞膜、内膜和脂肪滴,并会根据膜的相态表现出不同的荧光特性。

● 拥有脂质体模型、培养细胞和斑马鱼的染色实绩。

● ※ 有关斑马鱼的染色情况,请参考原著论文。

● 已确认本试剂的荧光特性几乎不受蛋白、多糖等的影响。

● 与现有的分子极性响应型荧光色素Laurdan相比,显示更高的光稳定性。


 

 

◆原著论文


Valanciunaite et al., Anal. Chem., 92, 6512-6520 (2020) Polarity Mapping of Cells and Embryos by Improved Fluorescent Solvatochromic Pyrene Probe.

 

 

◆观察注意事项


生物膜相态是通过荧光比来定量的,所以需要检测在405 nm激发下的两种波长的荧光。同时在Green频道约500-550 nm和Red频道约550-650 nm获得荧光,再使用各种分析软件算出荧光比。为获取荧光比,在每次荧光观察时需注意不能使信号饱和。这种色素在488 nm、560 nm处不吸收,所以可与一般的绿色、红色和近红外荧光发生共染色。建议获取以下溶液的荧光图像作为校准对照:

油(Labrafac oil)

脂肪滴检测标准

Sphingomielyne/Cholesterol

Lo标记

DOPC

Ld标记

◆应用数据


■ 活细胞成像


添加LipiORDER(300 nM in HBSS)至COS7细胞中,培养10 min后用激光共聚焦显微镜获取两种波长的荧光图像(激发光:405 nm;荧光Green:470-550 nm,Red:550 nm~)。通过ImageJ对绿色荧光图像和红色荧光图像进行比率测量分析(荧光比FR/FG),并用假色(LoLd)可视化相态。细胞膜的FR/FG低,估计在ER等细胞内膜中FR/FG高。

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Heat map的详细分析结果。

将比率测量分析图像的各个热图层抽出,并分析。


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■ 观察神经细胞膜的相结构

添加LipiORDER(300 nM in HBSS)至E17.5小鼠来源的海马原代神经细胞(DIV3或DIV12)中,培养10 min后用激光共聚焦显微镜获取两种波长的荧光成像(激发光:405 nm、荧光Green:470~550 nm,Red:550 nm~)。通过ImageJ对绿色荧光图像和红色荧光图像进行分析(荧光比FR/FG),并用假色(LoLd)可视化相态。通过比率测量分析,可观察到在所有膜结构中,细胞膜的FR/FG低,与Lo的环境接近;内膜结构的FR/FG高,与Ld的环境接近。

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■各个图像的荧光观察图像以及比例分析的应用。


在激光共聚焦显微镜的405 nm激发光下,使用绿色荧光图像(470-550 nm)和红色荧光图像(550 nm以上),并通过ImageJ算出比率测量分析图像。


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将比率测量分析图像的疑似色热图阶段性分割,可以看出,FR/FG(接近Lo)的信号,随着荧光比率不断增大(接近Ld),会距离细胞膜越来越远。

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■ 观察依赖于细胞外刺激的膜相态变化


用胆固醇去除剂的β-cyclodextrin(β-CD; 15 mM)处理COS7细胞4 h,清洗细胞,并添加LipiORDER(300 nM in HBSS),培养细胞10 min后用激光共聚焦显微镜获取两种波长的荧光图像(激发光:405nm,荧光Green:470-550nm,Red:550nm~)。通过ImageJ对绿色荧光图像和红色荧光图像进行比率测量分析(荧光比FR/FG),并用拟色(LoLd)可视化相态。通过β-CD处理可观察到细胞结构的显著变化,提取热图的深绿色层(荧光比0.06-0.34)时,发现其分布发生了很大的变化。

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※ 上述细胞染色数据,由名古屋市立大学大学院 药学研究科 服部光治教授提供。

■ 光稳定性


比较现有的分子极性检测试剂Laurdan和LipiORDER的光稳定性。与Laurdan表现出显著的光衰减相比,LipiORDER即使在暴露1 h后仍保持稳定。该试剂也可用于长期成像。

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※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。


产品列表
产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
FDV-0041  LipiORDER(Membrane Lipid Order Imaging Dye)
LipiORDER(膜脂质序成像染料) 
0.1 mg

LipiDye Lipid Droplet Green 高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

LipiDye Lipid Droplet Green
高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

  • 产品特性
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  • 参考文献

高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

LipiDye<Lipid Droplet Green>

LipiDye是一种可以对脂滴进行高灵敏染色的新型荧光素。与以往的脂滴检测色素Nile Red相比显示出高S/N比。活细胞和固定细胞均可使用。

※本产品用于研究,不可用于临床。

※本产品由名古屋大学转化生命分子研究所(ITbM)的研究成果商品化而来

Yamaguchi E., et al., Angew. Chem. Int. Ed., 54:4539~4543 (2015).

脂滴(Lipid droplet)的含义


脂滴(Lipid droplet)是在脂肪细胞(Adipocyte)中发现的巨大的中性脂质的结块,主要成分是甘油三酯(Triglyceride)和甾醇酯(Sterol Ester)的单分子层结构体。脂滴被认为是储存细胞内中性脂质的细胞器,并且有较多肥胖和疾病相关的报道。最近,除了脂肪细胞,还在肝细胞、平滑肌细胞、神经胶质细胞等各种细胞中发现了脂滴。这些发现明确了其不仅仅是作为中性脂质的储存场所,还有抑制代谢和基因表达调节等各种功能。非脂肪细胞的脂滴在1μm以下,与脂肪细胞中的10~100μm的脂滴相比较小。目渐多评论认为,脂滴是每个细胞中都存在的普遍的小型细胞器。实际上,近年来与脂滴研究相关的研究报告数量显著增加(据Pubmed的调查)。


脂类自噬(Lipophagy):脂滴的自噬


自2009年Nature初次报道自噬是脂滴分解的过程之后*,脂类自噬(Lipophagy)作为自噬抑制的脂质代谢引起人们的关注。脂类自噬的形成以及活性化机制作为基于脂滴分解的脂质代谢的新过程,期待它可以有效地预防脂质异常的疾病。

*Singh, et al., Nature., 458: 1131-1135. (2009).


LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

脂滴的模拟图 

 脂滴研究的时间推移

◆特点

● LipiDye是依存溶剂的分子极性发光的荧光素,选择性地吸收脂滴,使其在中性脂质中发出绿色的荧光

● 由于其在水溶液中没有荧光,所以细胞质中的非特异性发光被明显抑制,与以往的色素相比具有高S/N比。

● 也可用于脂滴的实时成像和固定细胞中的观察。

● 具有很高的光稳定性,是实时成像的理想选择。

● 低浓度的使用量(1 μM)就可获得足够地灵敏度,工作浓度(1 μM)几乎不显示细胞毒性。

◆化合物信息


● IUPAC name: 1,3-Diphenyl-2-[4-(N,N-diphenylamino)phenyl]benzo[b]phosphole-P-oxide

● 化学式 : C38H28NOP

● 分子量 : 545.58 g/mol

● 溶解度 : 可溶于DMSO


LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

◆波长


Excitation/ Emission: 405 nm / 521~530 nm


LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

※LipiDye用一般的绿色荧光色素使用的滤镜(FITC和GFP等)无法检测。请使用合适的滤镜。


检测试剂

活细胞

固定细胞

延时拍摄

多重染色

S/N比

LipiDye(本产品)

Nile Red

×

荧光色素B

×

脂肪染色试剂T

×

×

Oil Red O

×

×

×

◆使用案例


与Nile Red比较


脂肪细胞的脂滴用LipiDye或者Nile Red染色,检测箭头(左图)指示范围的荧光强度(右图)。无论是灵敏度还是S/N比LipiDye都比Nile Red高。脂滴中的荧光强度LipiDye较强(distance 0~10 μm),细胞质中的非特异性荧光信号Nile Red较强(distance 10~20 μm)。

LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

脂肪前驱细胞3T3-L1细胞的分化

用LipiDye观察脂肪前驱细胞3T3-L1的分化过程。可以看出,分化过程中脂滴不断变大。

LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

比较固定细胞

比较培养脂肪细胞用多聚甲醛固定后染色的情况(左图)和活细胞染色后用多聚甲醛固定的情况(右图),无论哪一种情况都可以高灵敏度地检测出脂滴。

※甲醇固定可能会影响到脂滴的构造,不建议使用。请使用多聚甲醛等的交联型固定试剂。


LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

验证光稳定性


评价了LipiDye和BODIPY493/503、Fluorescein、Prodan随着照射时间的光稳定性。LipiDye与其他的荧光素相比显示出了较高的光稳定性。



LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

验证细胞毒性


用MTT法评价LipiDye的细胞毒性。LipiDye几乎不影响细胞存活率。


LipiDye Lipid Droplet Green	                              高灵敏度的脂滴活细胞成像荧光染料

产品编号

生产厂家

产品名称

包装

FDV-0010

FNA

LipiDye <Lipid Droplet Green>

0.1mg

◆相关产品


功能

类别

品牌 产品编号 产品名称 包装 用途

细胞

凋亡

Wako 016-16831 Anti PARP, Monoclonal Antibody,
Affinity Purified

    聚腺苷二磷酸-核糖聚合酶

亲和纯化抗体

100 μg 细胞凋亡相关抗体

细胞

自噬

Wako 030-23703 Carbamazepine
卡马西平
50 g Na+ 通道抑制剂,细胞自噬相关化合物
Wako 047-18863 Dexamethasone
地塞米松
1 g  干细胞分化相关物质,细胞自噬相关化合物
Wako 079-03811 GF 109203X, 90.0+ % (HPLC)

双吲哚马来酰亚胺 I

(GF 109203X)

1 mg 蛋白激酶C选择性抑制剂,细胞自噬相关化合物
Wako 148-09431 NF 449 Octasodium Salt 10 mg 嘌呤受体拮抗剂,对P2X1具有高选择性
Wako 146-08533 Nocodazole
诺考达唑
50 mg 微管抑制剂。它具有抑制有丝分裂的作用。
Wako 163-18614 Paclitaxel
紫杉醇
100 mg 微管抑制剂。它具有抑制有丝分裂的作用。
Wako 011-22533 AICAR 1 g AMPK激活剂,细胞自噬相关化合物
Wako 058-06841 Epoxomicin 100 μg 蛋白酶抑制剂,细胞自噬相关化合物
Wako 131-17671 3-Methyladenine
3-甲基腺嘌呤
1 g 细胞自噬抑制剂
Wako 227-00753 Vinblastine Sulfate
    硫酸长春碱
50 mg 细胞自噬抑制剂
Wako 230-02341 (+)-Wortmannin, 97.0+ % (HPLC)
渥曼青霉素
2 mg 细胞自噬抑制剂
Wako 092-05581 Itraconazole
伊曲康唑
5 g 细胞自噬诱导剂
Wako 130-15485 Metformin Hydrochloride
盐酸二甲双胍
500 g 细胞自噬诱导剂
Biomol  BML-PI102-0025 MG-132 25 mg
Wako 188-02534 Rapamycin
雷帕霉素
50 mg 细胞自噬诱导剂
Wako 205-17283

Thapsigargin

毒胡萝卜素

5 mg 细胞自噬诱导剂
Wako 208-08243 Tunicamycin
衣霉素
50 mg 细胞自噬诱导剂
ENZO ENZ-KIT175-0050 CYTO-ID® Autophagy detection kit 2.0

Cyto-ID细胞自噬

检测试剂盒 2.0 

50 tests 细胞自噬荧光检测

LC3

研究

Wako 034-17973 Chloroquine Diphosphate
磷酸氯喹
100 g 自噬抑制剂,LC3研究相关相关化合物
Wako 164-17181 Plumbagin 1 g 诱导G2/ M细胞周期停滞,LC3研究相关相关化合物
Wako 246-00921 Xanthohumol 5 mg VCP抑制剂,
LC3研究相关相关化合物
Wako 013-22831 Anti Human Atg7, Rabbit 50 μL LC3研究相关抗体

用途 产品编号 产品名称 规格 包装
脂滴染色 144-08811 Nile Red
病理研究用 25 mg
140-08813 100 mg
141-06822 Nile Blue Hydrogensulfate 病理研究用 25 g
154-02072

Oil Red O

油红O

病理研究用 25 g
192-04392

Sudan Ⅲ

苏丹Ⅲ

和光特级 25 g
194-07652

Sudan Ⅳ

苏丹红IV

和光一级 25 g
192-04412

Sudan Black B

苏丹黑B

和光一级 25 g

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LipiDye, Lipid Droplet Green 品牌:Funakoshi


LipiDye, Lipid Droplet Green

品牌:Funakoshi
CAS No.:
储存条件:室温
纯度:
产品编号

(生产商编号)

等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

FDV-0010

0.1 mg 咨询


* 干冰运输、大包装及大批量的产品需酌情添加运输费用


* 零售价、促销产品折扣、运输费用、库存情况、产品及包装规格可能因各种原因有所变动,恕不另行通知,确切详情请联系上海金畔生物科技有限公司。

LipiORDER, Membrane Lipid Order Imaging Dye 品牌:Funakoshi


LipiORDER, Membrane Lipid Order Imaging Dye

品牌:Funakoshi
CAS No.:
储存条件:-20℃
纯度:
产品编号

(生产商编号)

等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

FDV-0041

0.1 mg 咨询


* 干冰运输、大包装及大批量的产品需酌情添加运输费用


* 零售价、促销产品折扣、运输费用、库存情况、产品及包装规格可能因各种原因有所变动,恕不另行通知,确切详情请联系上海金畔生物科技有限公司。

LipiRADICAL Green, Lipid Radical Detection Reagent 品牌:Funakoshi


LipiRADICAL Green, Lipid Radical Detection Reagent

品牌:Funakoshi
CAS No.:
储存条件:-20℃
纯度:
产品编号

(生产商编号)

等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

FDV-0042

0.1 mg 咨询


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* 零售价、促销产品折扣、运输费用、库存情况、产品及包装规格可能因各种原因有所变动,恕不另行通知,确切详情请联系上海金畔生物科技有限公司。

UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装 UltraRIPA kit for Lipid Raft

UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装
UltraRIPA kit for Lipid Raft

  • 产品特性
  • 相关资料
  • Q&A
  • 参考文献

UltraRIPA kit for Lipid RaftUltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft

大幅度提升膜蛋白提取效率的新一代 RIPA 缓冲液



  与常规的非变性细胞裂解缓冲液(RIPA buffer, 1% Triton X-100 等)相比,这款缓冲液套装(Buffer Kit)能迅速且高效地提取增溶相对困难的脂筏(Lipid Raft)蛋白质。从常规缓冲液中不可溶而丢弃的膜组分中,在维持蛋白质功能的情况下能实现高效地提取,有利于对脂筏等蛋白质的功能分析。

  ※本产品仅限于研究用。不可用于临床治疗。

 


◆细胞膜上的不溶性成分——脂筏(Lipid Raft)


  裂解细胞进行蛋白质功能分析的时候,经常会使用 RIPA (Radio-Immuno Precipitation Assay)缓冲液和1% Triton X-100 缓冲液等的相对温和的细胞膜裂解缓冲液。这些缓冲液对蛋白质的构造和功能的影响小,适用于酶活性试验、免疫沉降和各种结合实验等蛋白质的功能分析。另一方面,与具有很强的蛋白质变性作用的 SDS 缓冲液相比,增溶能力较弱,完全不能溶解以脂筏(Lipid Raft)为主的细胞膜组分。许多表面活性剂都不能溶解脂筏,故其又被称为 Detergent Resistant Membrane(DRM)。DRM中所含蛋白质的功能分析被认为是十分困难的。

 

UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft

 

  脂筏(Lipid Raft)是由胆固醇(cholesterol)和鞘磷脂(sphingomyelin),GPI锚定蛋白(GPI anchor protein)和棕榈酰化(palmitoylation)蛋白质组成的细胞膜构造,被认为是整合各种功能蛋白的功能域。神经细胞突触和免疫细胞的免疫突触是脂筏的代表性例子。

 

UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft

脂筏示意图



◆特点


操作简单,能快速提取脂筏蛋白

使用两种类型的缓冲液(A buffer,B buffer)进行两个阶段的提取。先提取出胞浆蛋白和非脂筏蛋白,然后提取脂筏蛋白

Buffer 提取的任何蛋白质都不会失活

A buffer 和一般的 RIPA buffer 成分相同*。B buffer 含有表面活性剂,可以通过透析除去

适用于哺乳动物细胞/组织

使用本品配制的溶解液适用于酶活性试验、免疫沉淀(Immunoprecipitation)、蛋白定量(BCA 法)、SDS-PAGE 和 Western blot 等

1% NP-40 Alternative,0.1% SDS,50 mMTris-HCl (pH8.0),150 mMNaCl,0.5% Sodium Deoxycholate

 

◆缓冲液套装组成


  ● A buffer (RIPA buffer) (100 mL)

  ● B buffer(10 mL)

UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft


◆使用方法


1、 用 A buffer 溶解组织或培养细胞。
为了提高溶解效率,推荐使用均质或超声波破碎设备。
2、

进行离心分离,使 A buffe r中可溶性组分(上层清液)和不溶性组分(沉淀)分离,分别回收。上层清液 A buffer 可溶性组分中主要含有胞浆蛋白和非脂筏蛋白。

3、 往沉淀的 A buffer 不溶性组分中加入 B buffer,形成悬浊液。
4、 进行离心分离,与步骤2一样分离出可溶性组分(上层清液)和不溶性组分(沉淀),分别回收。上层清液的 B buffer 可溶性组分中含有脂筏蛋白。
5、 可应用于各种实验。
A buffer 和 B buffer 不可用于 Bradford 法蛋白质定量。蛋白质定量请使用 BCA 检测。
使用本品 A buffer 和 B buffer 进行两个阶段的提取是最适宜的,也有只对细胞使用 B buffer 进行溶解和提取的例子。具体请参照以下例子。

UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft

UltraRIPA kit 、1% SDS buffer和RIPA buffer的比较


蛋白分离

蛋白结构

蛋白功能

应用

胞质蛋白

膜蛋白

非脂筏蛋白

脂筏蛋白

>1%SDS buffer

SDS-PAGE

RIPA   buffer

酶分析法测定

免疫沉淀

SDS-PAGE等

UltraRIPA

◆应用例


从脂筏中提取总蛋白


UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft

  用 UltraRIPA kit A buffer 溶解小鼠全脑组织后,回收 A buffer 不溶性组分(RIPA-insoluble fraction),添加2% SDS,RIPA buffer 和 UltraRIPA kit B buffer 进行提取。提取后的总蛋白用 SDS-PAGE/银染色检测(左),用 BCA 法定量蛋白质(右)。相对于具有很强的蛋白质变性作用的2% SDS 缓冲液,UltraRIPA kit 能够提取 70% 以上的蛋白质。

  ※不能保证全部蛋白质的可溶性都得到改善。

脂筏标记蛋白的提取


  用 UltraRIPA kit A buffer 溶解小鼠全脑组织后,回收 A buffer 不溶性组分(RIPA-insoluble fraction),添加2% SDS,RIPA buffer 和 UltraRIPA kit B buffer,提取后进行 SDS-PAGE。利用对应脂筏标记蛋白的抗体进行 Western blot 检测。


UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft


脂筏标记蛋白的免疫沉淀


  用 UltraRIPA kit A buffer 溶解小鼠全脑组织后,回收 A buffer 不溶性组分,通过 B buffer 提取脂筏标记蛋白。对 buffer 提取物使用脂筏标记蛋白 PSD95 的抗体和G蛋白偶联磁珠进行免疫沉淀。使用银染色和抗 PSD95 抗体通过 Western blot 检测进行确认。


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提取的蛋白质的酶活性测定


  用1%TritonX100,RIPA buffer,UltraRIPA kit B buffer 和2%SDS 溶解 CHO 细胞,测定溶解物中乳酸脱氢酶(LDH)的活性。2%SDS 具有很强的蛋白质变性作用,在几乎完全失活的情况下,1% Triton X100,UltraRIPA kit A buffer,和 UltraRIPA kit B buffer 所得的酶活性大致相同。


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从脂筏中提取功能蛋白


  用 UltraRIPA kit A buffer 溶解小鼠全脑组织后,回收 A buffer 不溶性组分。用 A buffer 分三次冲洗不溶性组分,消除 RIPA 可溶性组分中脱磷酸酶的活性。往不溶性组分中分别添加2% SDS buffer,A buffer(RIPA buffer)和 B buffer,测定各种提取物的总脱磷酸化酶活性。下图是各缓冲液从 RIPA 不溶性组分中提取的蛋白质的量(左轴:黑)和所检测的脱磷酸酶的活性(右轴:红)的示意图。2% SDS buffer 能够从 RIPA 不溶性组分中很好地提取蛋白质,但容易导致蛋白质变性,完全失去脱磷酸化活性。RIPA buffer 不能提取蛋白质,活性也无法检测。UltraRIPA kit B buffer 所提取的蛋白质大约为2% SDS buffer 的 70%,且可以检测出较强的脱磷酸化活性。

 

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UltraRIPA kit B buffer 单独提取脂筏蛋白的可能性评价

※数据提供:东京大学药学院研究生院保健化学系


  用 PBS 冲洗 COS-1 细胞,分别使用 SDS buffer,1% Triton X-100 buffer,UltraRIPA kit A buffer 和 UltraRIPA kit B buffer裂解,通过离心分离(14,000 rpm,5 min,4℃)可溶性组分和不可溶性组分。不可溶性组分用等量的 SDS-PAGE 样品缓冲液变性溶解。脂筏标记 Flotilin1 的可溶部分通过 SDS-PAGE/western blot 测定。使用1% Triton X-100 和 RIPA buffer,大部分的 Flotilin 1 不溶性膜组分没有被溶解,而 UltraRIPA kit B buffer 几乎可以全部溶解。


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◆各buffer组成


SDS buffer(2%SDS, 1% Triton X-100, 50 mM HEPES・Na (pH 7.2), 150 mM NaCl)

UltraRIPA kit A buffer (1% NP-40 Alternative,0.1% SDS,50 mM Tris-HCl (pH 8.0),150 mM NaCl,

0.5% Sodium Deoxycholate)

UltraRIPA kit B buffer (成分保密)
1% Triton X-100 (1% Triton X-100, 50 mM HEPES・Na (pH 7.2), 150mM NaCl)

欲了解更多相关产品信息,请点击文字:ULTRARIPA® Kit 应用数据

欲了解更多产品信息,可点击文字下载PDF:ULTRARIPA® Kit for Lipid Raft


相关资料


UltraRIPA 脂筏提取缓冲液套装                              UltraRIPA kit for Lipid Raft

UltraRIPA kit for Lipid Raft

Q-1.

如果单独使用B缓冲液,溶解效率是否高于 RIPA 缓冲液?

A-1.

B缓冲液的溶解活性比 RIPA(A缓冲液)高。本试剂盒的操作分为2个阶段,首先将 RIPA 不溶性组分回收并用B缓冲液将其溶解,并以浓缩和简单提取 RIPA 不溶性组分中含有的脂筏蛋白为目的而进行第2阶段的操作。但是,如果是直接用B缓冲液处理样本的时候,溶解率的确比 RIPA 高。


Q-2.

使用 ULTRARIPA® Kit 是否只可以提取脂筏蛋白?

A-2.

多数研究认为,脂筏的细胞膜穴样内陷和神经突触中含有的组成蛋白不能用 Triton X-100 等温和的表面活性剂溶解,因此认为表面活性剂的不溶性组分(DRM)是生化脂质筏。本产品着眼于 RIPA 不溶性组分富含的脂筏蛋白,用B缓冲液进一步使其溶解,使得脂筏蛋白在非变性状态下溶解。因此,即使不是脂筏,只要是不溶于 RIPA 的样本,都可以使用本试剂盒进行检测(关于核蛋白的污染参见 Q-3)。本试剂盒使用溶解能力较高的 RIPA 缓冲液作为A缓冲液,但是也可以用1% Triton X-100 等的裂解缓冲液代替 RIPA 缓冲液。


Q-3.

推荐使用均质或超声破碎设备,单独使用涡旋和移液是否不够充分?

A-3.

本产品采用A缓冲液溶解后离心,并回收 RIPA 不溶性组分这样简单的步骤。因此,如果有细胞/组织的未破碎物或核残留的话,则可能污染 RIPA 不溶性组分。特别是 RIPA 缓冲液的核溶解效率较弱,如果不添加物理破碎,则核可能会大量残留在 RIPA 不溶性组分中。另一方面,由于B缓冲液的核溶解率较高,如果有核残留的话就会释放出 DNA,使溶液变浑浊。在A缓冲液溶解时进行超声处理的话可以破坏核以及使基因组 DNA 片段化。核的污染可能会影响后续的应用,因此,我们强烈推荐使用均质或超声破碎设备。


Q-4.

B缓冲液的成分是什么种类的表面活性剂。听说表面活性剂的种类会影响电泳,我想知道它的成分。

A-4.

非常抱歉,B缓冲液的成分是非公开的。 我们无法告诉您表面活性剂的种类。然而,我们可以确定B缓冲液不会影响电泳。


Q-5.

几乎无法看见A不溶性组分。即使添加了B缓冲液也无法获取蛋白质量,怎么办?

A-5.

RIPA 缓冲液可以溶解90~95%包括膜蛋白在内的总蛋白(根据组织/细胞种的不同多少会有点差别)。因此,考虑蛋白质总量时,RIPA 不溶性组分中含有的蛋白为样本总体的10%以下。肉眼无法看见 RIPA 不溶性组分时,需要增加细胞数/组织量。想要提高B缓冲液溶解组分蛋白浓度时,减少添加至 RIPA 不溶性组分的B缓冲液的量就可以得到改善。我们建议您可以设置如下的阳性对照。


探讨样本量的阳性对照实验

需要准备的试剂:2% SDS缓冲液(50 mM Tris-HCl(pH 8.0),150 mM NaCl,2% SDS)

步骤:回收 RIPA 不溶性组分后,添加2%SDS缓冲液,通过进行蛋白质定量检测,可以预估 RIPA 不溶性组分中含有的蛋白质总量。


Q-6.

在A缓冲液溶解组分中可以观察到脂筏标记物,有什么改善的方法吗。

A-6.

我们无法保证在其他方法中作为脂筏标记物被检测出的蛋白能否在A缓冲液不溶性组分中获得。特别是根据脂筏标记物的不同,细胞种类/组织,有无外部信号也会有变动。我们会根据以下案例提供相关的改善方法,请酌情参考。

例1:不溶于1%Triton X-100,但用RIPA缓冲液可以检测出可溶性组分。

改善方法:可能是由于RIPA缓冲液(1%NP-40,0.1% SDS,0.5% sodium deoxycholate)的提取效率比1%Triton X-100强,所以能将其溶解。这时候,可以通过用1%Triton X-100缓冲液代替A缓冲液来浓缩以及溶解目的蛋白。

例2:离心条件不足时,虽然不溶解,但是不沉淀。

改善方法:虽然我们推荐的离心条件为10,000×g,但是根据目的蛋白的不同,离心10,000×g可能不足。这时,也有把离心条件调整为20,000×g之后得到改善的案例。因此,我们建议您可以探讨一下离心条件。

Q-7.

用B缓冲液洗脱的蛋白可以用于质谱分析吗?

A-7.

B缓冲液溶解的蛋白经过SDS-PAGE分离后,可以通过一般的蛋白质组学分析的顺序(切割凝胶,在凝胶中进行胰蛋白酶消化,提取肽以及脱盐操作)进行分析。


Q-8:

用B缓冲液提取后,我想用适合试验的缓冲液来置换它。 可以通过透析去除B缓冲液的表面活性剂吗?

A-8:

B缓冲液含有的表面活性剂可以通过透析去除。请使用孔径为5 kDa的透析膜。但是,也有根据蛋白质的不同,在去除表面活性剂时也可能会聚集或变性,需要添加别的表面活性剂到透析缓冲液中。建议进行预实验。

参考文献



1.

Taruno A, Sun H, Nakajo K, et al. Post-translational palmitoylation controls the voltage gating and lipid raft association of CALHM1 channel. [J]. Journal of Physiology, 2017, 595(18).

2.

Tan, H.R., Tan, J. R., Ng, Y. Y., Chua, J. E., Chew, W. S., & Muralidharan,S., er al. (2017). Enriched Expression of Neutral Sphingomyelinase 2 in the Striatum is Essential for Regulation of Lipid Raft Content and Motor Coordination. Molecular Neurobiology, 55(7), 5741–5756.


3.

Yusuke, T. , Busra, A. , Mihail, S. , Nurhan, O. , & Shigeaki, S. . (2018). Extracellular glucose level regulates dependence on GRP78 for cell surface localization of multi-pass transmembrane proteins in Hela cells. FEBS Letters.


4.

Araki, K. , Kawauchi, K. , Sugimoto, W. , Tsuda, D. , Oda, H. , & Yoshida, R. , et al. (2019). Mitochondrial protein e2f3d, a distinctive e2f3 product, mediates hypoxia-induced mitophagy in cancer cells. Communications biology, 2, 3.

5.
Kishimoto, S. , & Fukushima, S. . (2018). Abstract 5837: acquired resistance to anticancer drug of high glucose-exposed hepg2. Cancer Research, 78(13 Supplement), 5837-5837.

产品列表
产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
F015 UltraRIPA kit for Lipid Raft 1kit

Lipid A from E. coli R515 (Re) TLRpure Sterile Solution 脂质A来源于大肠杆菌 R515 (Re) TLR纯净无菌溶液 品牌:Innaxon


Lipid A from E. coli R515 (Re) TLRpure Sterile Solution

脂质A来源于大肠杆菌 R515 (Re) TLR纯净无菌溶液

品牌:Innaxon
CAS No.:
储存条件:+4°C
纯度:>99.9%. No detectable DNA, RNA and protein traces.
产品编号

(生产商编号)

等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

IAX-100-004-C500

500 µg 2,560.00


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* 零售价、促销产品折扣、运输费用、库存情况、产品及包装规格可能因各种原因有所变动,恕不另行通知,确切详情请联系上海金畔生物科技有限公司。

Lipid A from E. coli R515 (Re) TLRpure Sterile Solution 脂质A来源于大肠杆菌 R515 (Re) TLR纯净无菌溶液 品牌:Innaxon


Lipid A from E. coli R515 (Re) TLRpure Sterile Solution

脂质A来源于大肠杆菌 R515 (Re) TLR纯净无菌溶液

品牌:Innaxon
CAS No.:
储存条件:+4°C
纯度:>99.9%. No detectable DNA, RNA and protein traces.
产品编号

(生产商编号)

等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

IAX-100-004-M001

1 mg 4,540.00


* 干冰运输、大包装及大批量的产品需酌情添加运输费用


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Lipid IVa 品牌:Peptide


Lipid IVa

品牌:Peptide
CAS No.:
储存条件:-20℃
纯度:
产品编号

(生产商编号)

等级 规格 运输包装 零售价(RMB) 库存情况 参考值

337-00481

0.1mg 咨询


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脂质除去用电泳槽使脑部透明化 Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

脂质除去用电泳槽使脑部透明化
Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

  • 产品特性
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  • 参考文献

脂质除去用电泳槽使脑部透明化脂质除去用电泳槽使脑部透明化                              Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

          新型电泳槽使脑部透明化!!NA-1880 型电泳槽,可用于去除脂质

2013 年4 月11 日的自然杂志(Nature)电子版里介绍了组织透明化技术 CLARITY 法电泳去除脂质的方法,斯坦福大学的 Karl Deisseroth 教授等因此受到关注。这个方法的步骤是,向样品灌注并使其结合丙烯酰胺后,37℃电压 10 V~40 V 通电3小时引发聚合, 40℃ 10 V–60 V 电压电泳2天,循环含4%SDS 的硼酸盐缓冲液,去除脂质,使样品透明化。透明化的样品可用于后续的免疫染色分析。



脂质除去用电泳槽使脑部透明化                              Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

Nature 论文中的电泳装置:

样品使用 18 mm 的小鼠脑,电泳槽是电极间距 20 mm,高度20mm,内部直径为 40 mm 的圆筒状密闭循环型装置。为了安全,电泳槽上部还连接了硅胶密封的螺纹出口。

外连装置:

缓冲液循环泵(推荐使用 100 mL/min 以上的型号),能用于高电流的电泳电源(3860 型、3870 型等)、保温范围在 37~50℃的恒温水槽、加热器和 5 L 缓冲液槽。

脂质除去用电泳槽使脑部透明化                              Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction

规格:

主要材料:亚克力;

电极部分:铂金线、引线;

内置下槽(接续部分防水处理),附接续循环软管、滚动夹1个、异型软管接头2个

尺寸:70 mm x 70 mm x 90 mm;

重量:0.2 kg;

槽内部直径 40 mm 电极间距 20 mm;

耐热温度 65℃ * 铂金线直径 0.3 mm;

规格、尺寸等有可能变更。如有需要可订做电泳置,也可咨询直径 0.5 mm 型铂金线。

组织透明化辅助试剂

VA-044(聚合物引发剂)

产品列表
产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
631-26271 Electrophoresis Chamber For Lipid Extraction
脂质除去用电泳槽
1 台 免疫化学用